中心目标
通过建立高水平多学科学术梯队和有效机制，满足卫生政策与体制研究中高质量教学、科研和政策咨询的需要；
成为与国内外学术机构具有紧密联系并在国内具有领先地位的卫生政策与体制研究机构；

成为以发展中国家为主要对象的全球性卫生政策研究平台。

中心理念
创新：中心成员在科研、教学、政策咨询活动和项目中要具有创新性思维和手段；
合作：与北京大学校内外学术机构和资助机构建立合作关系；
多学科：建立一支由多学科人才组成的学术研究与教学队伍；
独立性：在科学研究中保持独立性；

关注未来：注重下一代卫生政策与卫生体制研究人员的能力建设；

中心使命
中心的使命是通过在国家卫生政策和体系领域的卓越研究和知识贡献，为促进中国人民的健康服务。中心工作将集中在健康问题测量、健康决定因素研究、卫生政策形成、卫生体系绩效监测和评价、学术交流等方面。为了实现使命，中心将建设和培养一支国际水平的多学科研究队伍和研究生队伍。